古稱壽春、壽陽、壽州。一說據《新唐書》：“鄭、汴，陳、蔡、穎為壽星分”。因系壽星分野，故曰壽縣。一說據“長壽”意命名。
　　戰國時為壽春邑，楚考烈王二十二年（公元前241）遷都于此。秦置壽春縣。晉武帝時以避鄭后諱改為壽陽縣。隋開皇九年（589年）置壽州。明初并壽春、安豐二縣入壽州。1912年改壽縣。
　　1949年1月17日壽春解放。先后屬六安專區、六安地區、六安市。

　　1997年，壽縣面積2986平方千米，人口120.9萬，轄18鎮14鄉：壽春鎮、正陽鎮、保義鎮、雙橋鎮、迎河鎮、板橋鎮、堰口鎮、隱賢鎮、石集鎮、眾興鎮、三覺鎮、炎劉鎮、小甸鎮、瓦埠鎮、豐莊鎮、澗溝鎮、劉崗鎮、雙廟集鎮、九龍鄉、建設鄉、張李鄉、開荒鄉、窯口鄉、荊塘鄉、瓦房鄉、廣巖鄉、李山鄉、大順鄉、茶庵鄉、八公山鄉、安豐塘鄉、陶店回族鄉。縣政府駐壽春鎮。
　　2000年第五次人口普查，全縣總人口1112569人，其中（22個鎮、10個鄉）：壽春鎮70777人，雙橋鎮49963人，澗溝鎮41937人，豐莊鎮33005人，正陽鎮16161人，迎河鎮58771人，板橋鎮55901人，安豐塘鎮37554人，堰口鎮37850人，保義鎮25904人，隱賢鎮38176人，楊仙鎮33562人，安豐鎮31558人，眾興鎮41483人，茶庵鎮26064人，三覺鎮26844人，炎劉鎮33465人，劉崗鎮37448人，雙廟集鎮27031人，小甸鎮31740人，瓦埠鎮26024人，大順鎮35515人，八公山鄉22173人，九龍鄉37079人，建設鄉37541人，張李鄉42850人，開荒鄉37916人，窯口鄉28498人，陶店回族鄉10804人，瓦房鄉22039人，廣巖鄉23452人，李山鄉25689人，壽西湖農場7795人。
　　2004年，壽縣將32個鄉鎮撤并為25個鄉鎮（21個鎮、4個鄉），鄉鎮平均面積由原來的85.22平方千米擴大到109.08平方千米，平均人口由原來的4.01萬人增加到5.13萬人。撤銷九龍、建設、開荒、楊仙、瓦房、廣巖和李山等7個鄉鎮。將九龍鄉整建制并入壽春鎮，鎮政府駐壽春鎮；將正陽鎮更名為正陽關鎮，建設鄉整建制并入，鎮政府駐新街；將開荒鄉的江黃居委會和蔡崗、廟莊、馬廠、塘拐、江黃、紅橋。許寺、九槐、八溝、半店等11個村委會并入堰口鎮，鎮政府駐堰口鎮；將開荒鄉的大郢、后樓、安東、油坊、橋灣、開荒、董郢、張羅、老莊、朱崗、東樓、謝崗、蘆橋、老套等14個村委會并入保義鎮，鎮政府駐保義集；將楊仙鎮整建制并入安豐鎮，鎮政府駐安豐路；將瓦房鄉整建制并入三覺鎮，鎮政府駐三覺寺；將廣巖鄉整建制并入炎劉鎮，鎮政府駐炎劉廟。保留雙橋等17個鄉鎮。
　　2007年11月，為確保合肥新橋國際機場建設順利進行，經安徽省政府批準，將六安市壽縣劉崗鎮的紅塘、柳塘、四沖3個行政村劃歸合肥市肥西縣。這3個村總面積為17.53平方千米、人口4033人。