全市轄龍子湖、蚌山、禹會、淮上4個市轄區，懷遠、五河、固鎮3個縣，共有19個街道、40個鎮、15個鄉（其中1個民族鄉）。市政府駐蚌山區東海大道3115號。

龍子湖區轄6個街道、1個鎮、1個鄉：東風街道、延安街道、治淮街道、東升街道、解放街道、曹山街道、長淮衛鎮、李樓鄉。區政府駐東升街道治淮路706號。

蚌山區轄7個街道、2個鄉：天橋街道、青年街道、緯二路街道、黃莊街道、宏業村街道、燕山鄉、雪華鄉；勝利街道、龍湖新村街道，湖濱社區行政事務管理中心、淮河社區行政事務管理中心。區政府駐淮河社區東海大道3858號。

禹會區轄5個街道、2個鎮、1個鄉：朝陽街道、緯四街道、大慶街道、張公山街道、釣魚臺街道、秦集鎮、馬城鎮、長青鄉。區政府駐金域社區涂山路429號。【注：5個街道實際已撤銷，改為朝陽、秀水、迎淮、張公山、金域、大慶、錦繡、釣魚臺、喜迎門9個社區公共服務中心】

淮上區轄1個街道、5個鎮：淮濱街道、小蚌埠鎮、吳小街鎮、曹老集鎮、梅橋鎮、沫河口鎮。區政府駐小蚌埠鎮淮五路。【注：淮濱街道實際已撤銷，改為淮濱社區公共服務中心】

懷遠縣轄12個鎮、6個鄉：城關鎮、鮑集鎮、龍亢鎮、河溜鎮、常墳鎮、雙橋集鎮、魏莊鎮、萬福鎮、唐集鎮、白蓮坡鎮、古城鎮、褚集鎮、淝南鄉、淝河鄉、陳集鄉、徐圩鄉、蘭橋鄉、荊芡鄉；龍亢農場。縣政府駐城關鎮禹都大道。

五河縣轄12個鎮、2個鄉（其中1個民族鄉）：城關鎮、新集鎮、小溪鎮、雙忠廟鎮、小圩鎮、東劉集鎮、頭鋪鎮、大新鎮、武橋鎮、朱頂鎮、澮南鎮、申集鎮、沱湖鄉、臨北回族鄉。縣政府駐城關鎮惠民路8號。

固鎮縣轄8個鎮、3個鄉：城關鎮、王莊鎮、新馬橋鎮、連城鎮、劉集鎮、任橋鎮、湖溝鎮、濠城鎮、石湖鄉、楊廟鄉、仲興鄉。縣政府駐城關鎮。