漢時(shí)南安縣地，宋朝后一直為嘉州（府）犍為縣轄地。1951年建五通橋市。1959年撤市為區(qū)，劃歸樂山縣。1962年為地轄區(qū)，1978年為樂山市（縣級(jí)）轄區(qū)。1985年置省轄樂山市五通橋區(qū)（縣級(jí)）。

1996年，五通橋區(qū)面積474平方千米，人口約32.6萬人。轄11個(gè)鎮(zhèn)、1個(gè)鄉(xiāng)：竹根鎮(zhèn)、牛華鎮(zhèn)、楊柳鎮(zhèn)、金山鎮(zhèn)、輝山鎮(zhèn)、橋溝鎮(zhèn)、金粟鎮(zhèn)、西壩鎮(zhèn)、石麟鎮(zhèn)、冠英鎮(zhèn)、蔡金鎮(zhèn)、新云鄉(xiāng)。區(qū)政府駐竹根鎮(zhèn)，距市政府22千米。

2000年第五次人口普查，五通橋區(qū)常住總?cè)丝?10229人，其中：竹根鎮(zhèn)57431人，牛華鎮(zhèn)40457人，楊柳鎮(zhèn)19141人，橋溝鎮(zhèn)19525人，金粟鎮(zhèn)22516人，金山鎮(zhèn)25935人，輝山鎮(zhèn)13582人，西壩鎮(zhèn)23753人，冠英鎮(zhèn)35632人，蔡金鎮(zhèn)15144人，石麟鎮(zhèn)25510人，新云鄉(xiāng)11603人。

2004年，五通橋區(qū)轄竹根、牛華、金粟、金山、橋溝、石麟、冠英、楊柳、輝山、蔡金、西壩11個(gè)鎮(zhèn)和新云1個(gè)鄉(xiāng)。

2010年第六次人口普查，五通橋區(qū)常住總?cè)丝?12086人，其中：竹根鎮(zhèn)75431人，牛華鎮(zhèn)42370人，楊柳鎮(zhèn)18371人，橋溝鎮(zhèn)16091人，金粟鎮(zhèn)19052人，金山鎮(zhèn)22851人，輝山鎮(zhèn)11238人，西壩鎮(zhèn)23045人，冠英鎮(zhèn)36013人，蔡金鎮(zhèn)13035人，石麟鎮(zhèn)23848人，新云鄉(xiāng)10741人。