東晉移萬安縣于今縣境，梁改萬安縣為潺亭縣。西魏置鹽亭縣，以境內鹽井而得名。或言因縣舊有秦亭，富有鹽井，因以名縣。

1996年，鹽亭縣面積1630平方千米，人口約60.7萬人。轄14個鎮、22個鄉：云溪鎮、富驛鎮、玉龍鎮、金孔鎮、兩河鎮、黃甸鎮、柏梓鎮、八角鎮、黑坪鎮、高燈鎮、金雞鎮、安家鎮、林農鎮、巨龍鎮、林山鄉、永泰鄉、大興回族鄉、黃溪鄉、龍泉鄉、麻秧鄉、三元鄉、五龍鄉、櫸溪鄉、折弓鄉、宗海鄉、洗澤鄉、金安鄉、馮河鄉、石牛廟鄉、雙碑鄉、茶亭鄉、來龍鄉、劍河鄉、毛公鄉、兩岔河鄉、新農鄉。縣政府駐云溪鎮。

2000年第五次人口普查，鹽亭縣常住總人口566541人，其中：云溪鎮71947人，玉龍鎮28542人，富驛鎮45558人，金孔鎮25833人，兩河鎮24608人，黃甸鎮28655人，柏梓鎮20688人，八角鎮25553人，黑坪鎮9763人，高燈鎮21620人，金雞鎮19037人，安家鎮12848人，林農鎮17974人，巨龍鎮10872人，龍泉鄉9320人，折弓鄉10742人，麻秧鄉9317人，三元鄉10698人，五龍鄉10683人，茶亭鄉8406人，金安鄉9945人，洗澤鄉20845人，毛公鄉13543人，馮河鄉13373人，石牛廟鄉14640人，大興回族鄉6763人，宗海鄉6900人，兩岔河鄉6288人，劍河鄉4757人，來龍鄉5098人，永泰鄉8002人，黃溪鄉8283人，櫸溪鄉9872人，雙碑鄉5450人，林山鄉4452人，新農鄉5666人。

2004年，鹽亭縣轄云溪、富驛、玉龍、金孔、兩河、黃甸、柏梓、八角、黑坪、高燈、金雞、安家、林農、巨龍14個鎮，龍泉、折弓、麻秧、馮河、石牛廟、宗海、兩岔河、林山、新農、三元、五龍、茶亭、金安、洗澤、毛公、劍河、來龍、永泰、黃溪、櫸溪、雙碑21個鄉和大興回族鄉。

2010年第六次人口普查，鹽亭縣常住總人口417221人，其中：云溪鎮72922人，玉龍鎮19849人，富驛鎮39015人，金孔鎮23177人，兩河鎮15768人，黃甸鎮19844人，柏梓鎮15944人，八角鎮16242人，黑坪鎮7652人，高燈鎮11327人，金雞鎮11909人，安家鎮8974人，林農鎮12778人，巨龍鎮9383人，龍泉鄉5091人，折弓鄉7322人，麻秧鄉6481人，三元鄉7271人，五龍鄉5382人，茶亭鄉4911人，金安鄉10022人，洗澤鄉14525人，毛公鄉8529人，馮河鄉7874人，石牛廟鄉9146人，大興回族鄉4954人，宗海鄉4404人，兩岔河鄉4343人，劍河鄉3317人，來龍鄉3610人，永泰鄉4158人，黃溪鄉4214人，櫸溪鄉7130人，雙碑鄉3017人，林山鄉3130人，新農鄉3606人。