據《陜西通志》：“縣有宜君水，因取名焉。”前秦苻堅置宜君護軍（在今耀州區城區），軍以川名。北魏太平真君七年（446）改為宜君縣，縣以軍名；于今縣東西村鄉石堡村置石保縣，屬中部郡。隋開皇三年（583）廢石保縣入宜君縣（治今耀州區境）。唐貞觀十七年（643）廢宜君縣，龍朔三年（663）析中部、同官兩縣地于今址復設宜君縣，屬坊州。五代、宋、金因之。

蒙古至元元年（1269）后屬鄜州。1913年屬榆林道。1928年直屬省。1948年屬陜甘寧邊區黃龍分區。1950年屬延安專區。1958年撤銷縣制，轄地分別并入銅川市和黃陵縣。1961年以原區域復置宜君縣，屬延安專區。1969年屬延安地區。1983年屬銅川市。

1996年，宜君縣面積1476平方千米，人口10萬人。轄2個鎮、12個鄉：城關鎮、五里鎮、偏橋鄉、西村鄉、堯生鄉、雷塬鄉、寺天鄉、云夢鄉、縣口鄉、棋盤鄉、焦坪鄉、哭泉鄉、高樓坬鄉、山岔鄉。縣政府駐城關鎮。

1997年，偏橋鄉改為偏橋鎮；棋盤鄉改為棋盤鎮；高樓坬鄉改為馬坊鎮；撤銷寺天鄉，將其管轄的馬莊、寺天、韓莊、躍進、背壕、安子頭6個村劃歸棋盤鎮管轄，新生、妖河、良河、拴馬4個村劃歸雷塬鄉管轄，張河、星星坡2個村劃歸五里鎮管轄。至此，宜君縣轄5個鎮、8個鄉。

2000年第五次人口普查，全縣常住總人口93141人，其中：城關鎮18606人、偏橋鎮10825人、五里鎮7015人、馬坊鎮5982人、棋盤鎮7118人、哭泉鄉5033人、焦坪鄉6623人、云夢鄉5629人、雷塬鄉5029人、縣口鄉4712人、山岔鄉3145人、堯生鄉6381人、西村鄉7043人。

2001年，宜君縣轄5個鎮、8個鄉：城關鎮（駐城關）、偏橋鎮（駐偏橋）、五里鎮（駐五里）、馬坊鎮（駐馬坊村）、棋盤鎮（駐棋盤）；哭泉鄉（駐哭泉）、西村鄉（駐石堡）、堯生鄉（駐西舍）、雷塬鄉（駐雷塬）、云夢鄉（駐南斗）、焦坪鄉（駐焦坪）、縣口鄉（駐縣口）、山岔鄉（駐山岔）。

2001年12月，偏橋鎮、山岔鄉合并設立彭鎮鎮，馬坊鎮、焦坪鄉合并設立太安鎮，撤銷縣口鄉并入云夢鄉。

2010年，宜君縣轄5個鎮、5個鄉：城關鎮、彭鎮鎮、五里鎮、太安鎮、棋盤鎮、哭泉鄉、云夢鄉、雷塬鄉、堯生鄉、西村鄉。縣政府駐城關鎮宜陽中街。

2010年第六次人口普查，宜君縣常住總人口91160人，其中：城關鎮20185人，彭鎮12966人，五里鎮5999人，太安鎮10201人，棋盤鎮7596人，哭泉鄉4579人，云夢鄉10638人，雷塬鄉5216人，堯生鄉6632人，西村鄉7148人。

2011年，撤銷雷塬鄉、堯生鄉合并設立堯生鎮。調整后，宜君縣轄6個鎮、3個鄉：城關鎮、彭鎮鎮、五里鎮、太安鎮、棋盤鎮、堯生鎮、哭泉鄉、云夢鄉、西村鄉。

2012年末，宜君縣面積1507.9平方千米，戶籍人口93933人，常住人口9.22萬人。2013年末，宜君縣轄6個鎮、3個鄉，共有2個社區、178個行政村，縣政府駐城關鎮。

2015年，撤銷西村鄉，并入五里鎮，鎮政府駐興市村，并在原西村鄉設立五里鎮西村綜合服務中心；撤銷哭泉鄉，將太安鎮的金牛村、云夢鄉的花莊村、蒼坊坪村、城關鎮的金盆村、南塔村劃歸哭泉鄉，設立哭泉鎮，鎮政府駐哭泉村；撤銷城關鎮，設立宜陽街道，街道辦事處駐宜陽中街。調整后，全縣轄1個街道、6個鎮、1個鄉：宜陽街道、彭鎮、五里鎮、太安鎮、棋盤鎮、堯生鎮、哭泉鎮、云夢鄉。