晉置郁平縣，南置方度縣，唐置南流縣，屬郁林州。民國降為郁林縣，1956年改玉林縣。1952年8月撤銷興業(yè)縣，歸并玉林縣。1983年撤銷玉林縣，設(shè)立玉林市（縣級）。
1996年，玉林市面積2736平方千米，人口約144萬人。轄20個(gè)鎮(zhèn)、10個(gè)鄉(xiāng)：玉林鎮(zhèn)、南江鎮(zhèn)、城西鎮(zhèn)、名山鎮(zhèn)、城北鎮(zhèn)、茂林鎮(zhèn)、新橋鎮(zhèn)、沙田鎮(zhèn)、樟木鎮(zhèn)、福綿鎮(zhèn)、成均鎮(zhèn)、仁東鎮(zhèn)、大平山鎮(zhèn)、石南鎮(zhèn)、葵陽鎮(zhèn)、城隍鎮(zhèn)、山心鎮(zhèn)、沙塘鎮(zhèn)、蒲塘鎮(zhèn)、北市鎮(zhèn)、小平山鄉(xiāng)、賣酒鄉(xiāng)、大塘鄉(xiāng)、洛陽鄉(xiāng)、高峰鄉(xiāng)、博愛鄉(xiāng)、鐵聯(lián)鄉(xiāng)、仁厚鄉(xiāng)、龍安鄉(xiāng)、石和鄉(xiāng)。市政府駐玉林鎮(zhèn)。
1997年4月22日，國務(wù)院（國函[1997]26號）批準(zhǔn)同意撤銷玉林地區(qū)和縣級玉林市，設(shè)立地級玉林市。原縣級玉林市分設(shè)玉州區(qū)和興業(yè)縣：玉州區(qū)轄原縣級玉林市的玉林、福綿、南江、城西、名山、仁東、樟木、成均、新橋、城北、茂林、沙田12個(gè)鎮(zhèn)和石和、仁厚、大塘3個(gè)鄉(xiāng)，區(qū)政府駐玉林鎮(zhèn)民主路；興業(yè)縣轄原縣級玉林市的石南、城隍、大平山、蒲塘、北市、葵陽、沙塘、山心8個(gè)鎮(zhèn)和龍安、鐵聯(lián)、博愛、高峰、洛陽、小平山、賣酒7個(gè)鄉(xiāng)，縣政府駐石南鎮(zhèn)。【注：福綿、成均、樟木、新橋、沙田、石和6個(gè)鎮(zhèn)實(shí)際由福綿管理區(qū)管理】
2000年第五次人口普查，玉州區(qū)總?cè)丝?18229人。其中：玉林鎮(zhèn)201721人，南江鎮(zhèn)77813人，城西鎮(zhèn)51516人，城北鎮(zhèn)45061人，名山鎮(zhèn)72220人，茂林鎮(zhèn)51408人，仁東鎮(zhèn)49296人，福綿鎮(zhèn)69053人，成均鎮(zhèn)64811人，樟木鎮(zhèn)70497人，新橋鎮(zhèn)51823人，沙田鎮(zhèn)44758人，仁厚鄉(xiāng)24193人，大塘鄉(xiāng)19173人，石和鄉(xiāng)24886人。
2000年6月20日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2000]127號）同意仁厚鄉(xiāng)改為鎮(zhèn)建制，原轄行政區(qū)域不變。2001年4月6日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2001]53號）同意石和鄉(xiāng)改為鎮(zhèn)建制，原轄行政區(qū)域不變；12月24日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2001]455號）同意大塘鄉(xiāng)改為鎮(zhèn)建制，所轄行政區(qū)域不變。調(diào)整后，全區(qū)轄15個(gè)鎮(zhèn)。
2003年7月，撤銷玉林鎮(zhèn)，改設(shè)玉城街道。2005年6月13日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2005]163號）同意調(diào)整玉州區(qū)部分鄉(xiāng)鎮(zhèn)的行政區(qū)劃：撤銷南江鎮(zhèn)，改設(shè)街道辦事處，以原南江鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)樵摻值擂k事處的轄區(qū)；撤銷名山鎮(zhèn)，改設(shè)街道辦事處，以原名山鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)樵摻值擂k事處的轄區(qū)；撤銷城西鎮(zhèn)，改設(shè)街道辦事處，以原城西鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)樵摻值擂k事處的轄區(qū)；撤銷城北鎮(zhèn)，改設(shè)街道辦事處，以原城北鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)樵摻值擂k事處的轄區(qū)。
全區(qū)現(xiàn)轄5個(gè)街道、10個(gè)鎮(zhèn)：玉城街道、南江街道、城西街道、城北街道、名山街道、大塘鎮(zhèn)、茂林鎮(zhèn)、仁東鎮(zhèn)、福綿鎮(zhèn)、成均鎮(zhèn)、樟木鎮(zhèn)、新橋鎮(zhèn)、沙田鎮(zhèn)、石和鎮(zhèn)、仁厚鎮(zhèn)。區(qū)政府駐玉城街道民主路。【注：福綿、成均、樟木、新橋、沙田、石和6個(gè)鎮(zhèn)實(shí)際由福綿管理區(qū)管理；玉東新區(qū)托管位于二環(huán)路（迎賓大道）以外（不含二環(huán)路）的茂林鎮(zhèn)和名山街道所轄的教育東路延長線沿線及其以南的和睦村、榕樓村、石棠社區(qū)、大囊村、長望村，規(guī)劃用地面積112.53平方千米】