秦末漢初，南越王趙佗就在仁化北端隘口筑有“古秦城”。南越歸漢，仁化為曲江縣地。南朝齊年間（479年至502年）析曲江縣地置仁化縣。南朝梁并入曲江縣。唐垂拱四年（688年）復置仁化縣。宋開寶六年（973年）并入樂昌縣，咸平三年（1000年）復置仁化縣。1958年并入韶關市，1961年復置仁化縣。

1996年，仁化縣面積1821平方千米，人口約18萬人。轄9個鎮：仁化鎮、丹霞鎮、長江鎮、石塘鎮、紅山鎮、扶溪鎮、城口鎮、聞韶鎮、董塘鎮。縣政府駐仁化鎮。

2000年第五次人口普查，仁化縣常住總人口163213人，其中：仁化鎮43826人、丹霞鎮6300人、聞韶鎮4439人、扶溪鎮10787人、長江鎮21110人、城口鎮8789人、紅山鎮8017人、石塘鎮10761人、董塘鎮31469人、凡口鉛鋅礦13932人、廣東鋁廠2282人、七四五礦1501人。

2002年，仁化縣轄仁化、城口、長江、扶溪、董塘、石塘、聞韶、丹霞、紅山9個鎮，88個村委會、13個居委會。

2004年5月29日，國務院批準（國函[2004]40號）調整韶關市部分行政區劃：將原曲江縣的黃坑鎮、周田鎮、大橋鎮劃歸仁化縣管轄。調整前，仁化縣面積1822平方千米，人口17萬人。調整后，仁化縣轄仁化、城口、長江、扶溪、董塘、石塘、聞韶、丹霞、紅山、黃坑、大橋、周田12個鎮。

2006年6月7日，廣東省民政廳（粵民區[2006]28號）批準同意撤銷丹霞鎮、仁化鎮，設立丹霞街道（9月實施）。

2008年末，仁化縣戶籍總人口229861人，其中非農業人口81951人。2009年末，仁化縣轄1個街道、10個鎮，13個居委會、110個行政村。縣政府駐丹霞街道。

2010年第六次人口普查，仁化縣常住總人口200354人，其中：丹霞街道59344人，聞韶鎮4420人，扶溪鎮9407人，長江鎮21293人，城口鎮8537人，紅山鎮7346人，石塘鎮9138人，董塘鎮32069人，大橋鎮7269人，周田鎮18929人，黃坑鎮8509人，中金嶺南公司凡口鉛鋅礦10893人，曲仁礦務局格頂礦區3200人。

2011年末，仁化縣總面積2223平方千米。常住人口20.17萬人，戶籍人口234616人，其中農業人口179553人。轄1個街道、10個鎮，124個村（居）。