永修，古艾地，秦隸九江郡。漢高祖六年置海昏縣（縣治設今吳城鎮蘆潭西北1千米處）。南朝宋元嘉二年（425）“廢海昏，移建昌居焉”，改名建昌縣（縣治在今艾城）。元元貞元年（1295）升建昌為州。明朝改稱建昌縣。
　　民國三年（1914），因與四川省建昌道同名，改為永修縣，因境內修水得名，取其“泮臨修水，永受其利”之意。

　　1979年，設立城山公社（贛革發[1979]10號）。1987年3月30日，設置南崗鄉、八角嶺鄉（贛府廳字[1987]1158號批復）。1990年10月22日，撤銷虬津鄉，設立虬津鎮（贛民字[1990]140號批復）。
　　1993年1月3日，撤銷艾城鄉、白槎鄉、江益鄉，設立艾城鎮、白槎鎮、江益鎮；撤銷南崗鄉、八角嶺鄉；立新鄉政府駐地由楊泗村遷至中村杜家山（贛民字[1993]3號批復）。
　　1995年3月10日，撤銷灘溪鄉、三溪橋鄉、梅棠鄉，設立灘溪鎮、三溪橋鎮、梅棠鎮（贛民字[1995]35號批復）。
　　1997年，全縣面積2035平方千米，人口34萬。轄10個鎮、8個鄉：涂埠鎮、三溪橋鎮、江益鎮、白槎鎮、柘林鎮、吳城鎮、梅棠鎮、虬津鎮、艾城鎮、灘溪鎮、江上鄉、九合鄉、三角鄉、永興鄉、立新鄉、燕坊鄉、馬口鄉、城豐鄉。縣政府駐涂埠鎮。
　　1999年3月4日，撤銷燕坊鄉、馬口鄉，設立燕坊鎮、馬口鎮（贛民字[1999]50號批復）。至此，全縣轄12個鎮、6個鄉。
　　2000年第五次人口普查，全縣總人口351457人；其中：涂埠鎮45570人、柘林鎮12467人、三溪橋鎮12228人、白槎鎮12660人、梅棠鎮13585人、虬津鎮21421人、灘溪鎮16700人、燕坊鎮11417人、艾城鎮21133人、馬口鎮17351人、吳城鎮14300人、江益鎮11328人、江上鄉12472人、立新鄉23566人、城豐鄉6650人、永興鄉10068人、九合鄉18379人、三角鄉21656人、云山集團公司35835人、恒豐企業集團12671人。
　　2002年1月11日，撤銷永興鄉，劃歸涂埠鎮（贛民字[2002]10號批復）。2002年底，永修縣面積2035平方千米，人口35.5萬人，其中非農業人口11.8萬人。轄12個鎮、5個鄉，26個居委會、187個行政村。縣政府駐涂埠鎮。
　　2003年10月10日，撤銷城豐鄉，成建制劃歸馬口鎮管轄；撤銷三溪橋鎮，成建制劃歸柘林鎮管轄（贛民字[2003]260號批復）。2003年底，全縣總人口36.1萬人。轄11鎮4鄉：涂埠鎮、吳城鎮、柘林鎮、虬津鎮、艾城鎮、灘溪鎮、白槎鎮、梅棠鎮、燕坊鎮、馬口鎮、江益鎮（共青）、三角鄉、九合鄉、立新鄉、江上鄉。
　　2006年9月20日，恢復三溪橋鎮和柘林鎮。