喀什是維吾爾語“喀什噶爾”音譯的簡稱，其語源有突厥語、古伊蘭語、波斯語等融演而成，含意有“各色磚房”、“玉石集中之地”、“初創”等不同的解釋。今日的喀什地區古代稱疏勒、任汝、疏附，包括古代的疏勒（今喀什市、疏附縣、疏勒縣、伽師縣一帶）、蒲犁（今塔什庫爾干）、莎車、依耐（今英吉沙和阿克陶境內）、烏禾宅 （今塔什庫爾干南部）、西夜（今葉城）等諸國地。秦末漢初，這些地方屬于匈奴的僮仆都尉管轄。漢武帝元狩四年（公元前119年），漢博望候張騫奉旨通西域時進駐疏勒，這里始為漢朝所控制。公元前60年，漢朝在新疆設置西域都護府，喀什作為西域的一部分，正式列入祖國版圖。

唐太宗以后，這里為唐朝政府的重要軍事據點，當時的安西四鎮之一即為喀什噶爾。五代至宋，先后為喀喇汗王朝和西遼所管轄。喀喇汗王朝時期，曾以喀什噶爾為首府。成吉思汗西征后，屬次子察合臺太子的封地。葉爾羌汗國時，喀什曾作為輔助中心，起著重要的作用。清乾隆時期這兒是清政府“總理南八城事宜”的喀什噶爾參贊大臣的駐地。光緒十年（1884年），置喀什噶爾道，共轄有疏勒、莎車兩個府和英吉沙爾直隸廳、蒲犁分防廳、和闐直隸州。

民國年間改為喀什行政區，設行政長公署于疏附。民國32年（1943）改名新疆第三（喀什）行政區。還有第十（莎車）行政區。解放后建立了喀什專區和莎車專區。1956年撤銷莎車專區，并入喀什專區，1971年1月，喀什專區改為喀什地區。

1982年11月6日，喀什行署決定，將喀什市浩罕、伯什克然木、阿瓦提、英吾斯坦4個公社及河內林場劃歸疏附縣。

1998年3月1日，經自治區政府批準，將疏附縣浩罕鄉、伯什克然木鄉5個村、阿瓦提鄉2個村、帕哈太克里鄉1個村、疏勒縣城關鎮1個村的3個村民小組劃歸喀什市管轄。1998年底，喀什地區總人口為327．95萬人，其中少數民族人口占總人口的90．97％。

2000年第五次全國人口普查，喀什地區常住總人口3405713人。其中：喀什市340640人、疏附縣345282人、疏勒縣284853人、英吉沙縣213338人、澤普縣181721人、莎車縣620329人、葉城縣370229人、麥蓋提縣201810人、岳普湖縣129441人、伽師縣311733人、巴楚縣375883人、塔什庫爾干縣30454人。

2001年末，全區總人口342.68萬人，其中少數民族人口占總人口的90%。2002年末，全區總人口348.76萬人，其中城鎮人口70.58萬人。

2003年末，喀什地區總人口3501198人，其中城鎮人口81.95萬人。轄1個市、11個縣，共有8個區公所，26個鎮、4個街，141個鄉，2310個村委會、96個居委會。境內還駐有新疆生產建設兵團農業第三師所轄16個團場以及自治區屬管單位、農場、石油基地、軍事機關等單位。

2004年末，喀什地區總人口361.54萬人，其中城鎮人口83.42萬人。

2004年8月2日，經自治區政府批準，將疏附縣的色滿鄉、荒地鄉劃歸喀什市管轄。2005年2月24日，經自治區政府批準，將疏附縣的帕哈太克里鄉、伯什克然木鄉劃歸喀什市管轄。

2010年第六次人口普查，喀什地區常住總人口3979321人，其中：喀什市506640人，疏附縣311960人，疏勒縣312455人，英吉沙縣262067人，澤普縣206936人，莎車縣762385人，葉城縣454328人，麥蓋提縣258978人，岳普湖縣147688人，伽師縣381767人，巴楚縣336274人，塔什庫爾干塔吉克自治縣37843人。

2013年3月，自治區政府（新政函[2013]35號）同意將疏附縣阿瓦提鄉劃歸喀什市管轄；同年，自治區政府（新政函[2013]207號）批準同意將疏附縣英吾斯坦鄉劃歸喀什市管轄（11月20日正式實施）。2014年10月21日，自治區政府（新政函[2014]194號）同意將疏附縣阿克喀什鄉劃歸喀什市管轄。