西肥城市因西周時期稱肥子國而得名。周時期肥族人散居于此，稱肥子國。漢置肥城縣。因其地為春秋時肥國遺民散居之處，故名。1992年3月1日，撤銷肥城縣，設立肥城市。

1949年6月，肥城縣行政區(qū)劃為10區(qū)1鎮(zhèn)，即第一區(qū)（城關）、第二區(qū)（巧山店）、第三區(qū)（安臨站）、第四區(qū)（王莊）、第五區(qū)（王瓜店）、第六區(qū)（湖屯）、第七區(qū)（石橫）、第八區(qū)（安駕莊）、第九區(qū)（高淤）、第十區(qū)（邊院）和城關鎮(zhèn)。1951年，將上營、王先莊、代家河、楊家莊、侯家莊、李家峪6個自然村劃歸長清縣。1958年3月，將西北部的段家天井、鐵山、荒場等3個自然村劃歸平陰縣所轄。

1958年9月，全縣先后建立城關、儀陽、安臨站、王莊、王瓜店、湖屯、石橫、安駕莊、汶陽、邊院、桃園、馬家埠、過村、孫伯14個公社。1959年7月，將長清縣的雙泉、馬山、五峰3個公社共177個自然村劃歸肥城縣。1960年1月，撤銷過村、馬家埠、五峰3個公社。1961年5月，將馬山、雙泉2個公社177個自然村復劃歸長清縣。全縣時轄12個公社、57個管理區(qū)、572個生產大隊。1982年3月，增設劉家莊鎮(zhèn)。

1983年12月23日，全縣行政區(qū)劃改為1鎮(zhèn)12區(qū)。1985年11月5日，全縣行政區(qū)調整為9鎮(zhèn)8鄉(xiāng)593個行政村。1992年9月5日，撤銷新城鎮(zhèn)，設立新城街道辦事處，為肥城市的派出機構，其管轄范圍為原新城鎮(zhèn)的行政區(qū)域。1993年8月30日，撤銷潮泉鄉(xiāng)，設立潮泉鎮(zhèn)；撤銷安臨站鄉(xiāng)，設立安臨站鎮(zhèn)；撤銷王莊鄉(xiāng)，設立王莊鎮(zhèn)。1996年1月3日，撤銷馬家埠鄉(xiāng)，設立馬家埠鎮(zhèn)（魯政函民字[1996]3號）。1996年1月11日，撤銷過村鄉(xiāng)、孫伯鄉(xiāng)，設立過村鎮(zhèn)、孫伯鎮(zhèn)（魯政函民字[1996]6號）。

1996年，肥城市面積1263.1平方千米，人口98.2萬人。轄1個街道、14個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)：新城辦事處、老城鎮(zhèn)、潮泉鎮(zhèn)、王瓜店鎮(zhèn)、桃園鎮(zhèn)、王莊鎮(zhèn)、湖屯鎮(zhèn)、石橫鎮(zhèn)、儀陽鄉(xiāng)、安站鎮(zhèn)、東陸房鄉(xiāng)、孫伯鎮(zhèn)、安駕莊鎮(zhèn)、馬莊埠鎮(zhèn)、過村鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)、汶陽鎮(zhèn)。市政府駐新城街道。

1997年末，肥城市面積1277平方千米，轄1個街道、14個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)：新城街道轄27個行政村，人口92768人，其中農業(yè)人口34838人；老城鎮(zhèn)轄33個行政村，人口80289人，其中農業(yè)人口37737人；潮泉鎮(zhèn)轄11個行政村，人口23677人，其中農業(yè)人口21260人；王瓜店鎮(zhèn)轄32個行政村，人口80371人，其中農業(yè)人口58291人；桃園鎮(zhèn)轄42個行政村，人口58877人，其中農業(yè)人口55125人；王莊鎮(zhèn)轄53個行政村，人口56857人，其中農業(yè)人口54362人；湖屯鎮(zhèn)轄48個行政村，人口81121人，其中農業(yè)人口45611人；石橫鎮(zhèn)轄43個行政村，人口82682人，其中農業(yè)人口44451人；儀陽鄉(xiāng)轄49個行政村，人口46965人，其中農業(yè)人口44909人；安臨站鎮(zhèn)轄27個行政村，人口36037人，其中農業(yè)人口34329人；東陸房鄉(xiāng)轄21個行政村，人口25995人，其中農業(yè)人口25152人；孫伯鎮(zhèn)轄17個行政村，人口30585人，其中農業(yè)人口29058人；安駕莊鎮(zhèn)轄45個行政村，人口55195人，其中農業(yè)人口52351人；馬家埠鎮(zhèn)轄26個行政村，人口33822人，其中農業(yè)人口32702人；過村鎮(zhèn)轄35個行政村，人口31279人，其中農業(yè)人口30109人；邊院鎮(zhèn)轄45個行政村，人口53729人，其中農業(yè)人口51217人；汶陽鎮(zhèn)轄53個行政村，人口82343人，其中農業(yè)人口78883人。

1998年末，肥城市面積1277平方千米，轄1個街道、14個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)。新城街道轄27個行政村，人口97671人，其中農業(yè)人口36081人；老城鎮(zhèn)轄33個行政村，人口80270人，其中農業(yè)人口37466人；潮泉鎮(zhèn)轄11個行政村，人口23584人，其中農業(yè)人口21134人；王瓜店鎮(zhèn)轄32個行政村，人口80303人，其中農業(yè)人口57936人；桃園鎮(zhèn)轄42個行政村，人口58832人，其中農業(yè)人口54803人；王莊鎮(zhèn)轄53個行政村，人口56289人，其中農業(yè)人口53823人；湖屯鎮(zhèn)轄48個行政村，人口81350人，其中農業(yè)人口45282人；石橫鎮(zhèn)轄43個行政村，人口83481人，其中農業(yè)人口43894人；儀陽鄉(xiāng)轄49個行政村，人口46428人，其中農業(yè)人口44351人；安臨站鎮(zhèn)轄27個行政村，人口35838人，其中農業(yè)人口34067人；東陸房鄉(xiāng)轄21個行政村，人口25806人，其中農業(yè)人口24937人；孫伯鎮(zhèn)轄17個行政村，人口30976人，其中農業(yè)人口29453人；安駕莊鎮(zhèn)轄45個行政村，人口55140人，其中農業(yè)人口52146人；馬家埠鎮(zhèn)轄26個行政村，人口33574人，其中農業(yè)人口32426人；過村鎮(zhèn)轄35個行政村，人口31102人，其中農業(yè)人口29904人；邊院鎮(zhèn)轄45個行政村，人口53419人，其中農業(yè)人口50834人；汶陽鎮(zhèn)轄53個行政村，人口81684人，其中農業(yè)人口78081人。

1999年末，肥城市面積1277平方千米，轄1個街道、14個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)。新城街道轄27個行政村，人口103775人，其中農業(yè)人口36100人；老城鎮(zhèn)轄33個行政村，人口80205人，其中農業(yè)人口47800人；潮泉鎮(zhèn)轄11個行政村，人口23492人，其中農業(yè)人口20600人；王瓜店鎮(zhèn)轄32個行政村，人口80194人，其中農業(yè)人口57200人；桃園鎮(zhèn)轄42個行政村，人口58633人，其中農業(yè)人口52200人；王莊鎮(zhèn)轄53個行政村，人口56035人，其中農業(yè)人口53600人；湖屯鎮(zhèn)轄48個行政村，人口82107人，其中農業(yè)人口46600人；石橫鎮(zhèn)轄43個行政村，人口83765人，其中農業(yè)人口52400人；儀陽鄉(xiāng)轄49個行政村，人口46052人，其中農業(yè)人口42700人；安臨站鎮(zhèn)轄27個行政村，人口35572人，其中農業(yè)人口34000人；東陸房鄉(xiāng)轄21個行政村，人口25646人，其中農業(yè)人口24700人；孫伯鎮(zhèn)轄17個行政村，人口30855人，其中農業(yè)人口25000人；安駕莊鎮(zhèn)轄45個行政村，人口55062人，其中農業(yè)人口49900人；馬家埠鎮(zhèn)轄26個行政村，人口33367人，其中農業(yè)人口31700人；過村鎮(zhèn)轄35個行政村，人口30965人，其中農業(yè)人口29700人；邊院鎮(zhèn)轄45個行政村，人口53184人，其中農業(yè)人口49800人；汶陽鎮(zhèn)轄53個行政村，人口81187人，其中農業(yè)人口77200人。

2000年第五次人口普查，肥城市總人口948602人，其中：新城街道120262人，老城鎮(zhèn)70368人，潮泉鎮(zhèn)22885人，王瓜店鎮(zhèn)81935人，桃園鎮(zhèn)56616人，王莊鎮(zhèn)53424人，湖屯鎮(zhèn)79695人，石橫鎮(zhèn)85551人，安臨站鎮(zhèn)34659人，孫伯鎮(zhèn)30030人，安駕莊鎮(zhèn)53746人，馬家埠鎮(zhèn)31748人，過村鎮(zhèn)29841人，邊院鎮(zhèn)51423人，汶陽鎮(zhèn)78201人，儀陽鄉(xiāng)43733人，東陸房鄉(xiāng)24485人。

2000年末，肥城市面積1277平方千米，轄1個街道、12個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：新城辦事處、老城鎮(zhèn)、潮泉鎮(zhèn)、王瓜店鎮(zhèn)、桃園鎮(zhèn)、王莊鎮(zhèn)、湖屯鎮(zhèn)、石橫鎮(zhèn)、儀陽鄉(xiāng)、安臨站鎮(zhèn)、孫伯鎮(zhèn)、安駕莊鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)、汶陽鎮(zhèn)。新城街道轄27個行政村，人口107398人，其中農業(yè)人口3.21萬人；老城鎮(zhèn)轄33個行政村，人口80284人，其中農業(yè)人口3.87萬人；潮泉鎮(zhèn)轄11個行政村，人口23446人，其中農業(yè)人口2.06萬人；王瓜店鎮(zhèn)轄32個行政村，人口80270人，其中農業(yè)人口5.74萬人；桃園鎮(zhèn)轄42個行政村，人口58480人，其中農業(yè)人口5.38萬人；王莊鎮(zhèn)轄53個行政村，人口55862人，其中農業(yè)人口5.37萬人；湖屯鎮(zhèn)轄48個行政村，人口81845人，其中農業(yè)人口4.47萬人；石橫鎮(zhèn)轄43個行政村，人口84253人，其中農業(yè)人口4.50萬人；儀陽鄉(xiāng)轄49個行政村，人口45802人，其中農業(yè)人口4.27萬人；安臨站鎮(zhèn)轄48個行政村，人口60852人，其中農業(yè)人口5.87萬人；孫伯鎮(zhèn)轄17個行政村，人口31326人，其中農業(yè)人口2.50萬人；安駕莊鎮(zhèn)轄71個行政村，人口88076人，其中農業(yè)人口8.14萬人；邊院鎮(zhèn)轄80個行政村，人口83829人，其中農業(yè)人口7.95萬人；汶陽鎮(zhèn)轄53個行政村，人口80662人，其中農業(yè)人口7.72萬人。（缺居委會統(tǒng)計數據）

2001年2月，將東陸房鄉(xiāng)、馬家埠鎮(zhèn)、過村鎮(zhèn)分別并入安臨站鎮(zhèn)、安駕莊鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)。調整后，全市行政區(qū)轄1個街道、12個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)，共607個村（居）委會。2001年末，肥城市面積1277平方千米，轄1個街道、12個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：新城辦事處、老城鎮(zhèn)、潮泉鎮(zhèn)、王瓜店鎮(zhèn)、桃園鎮(zhèn)、王莊鎮(zhèn)、湖屯鎮(zhèn)、石橫鎮(zhèn)、儀陽鄉(xiāng)、安臨站鎮(zhèn)、孫伯鎮(zhèn)、安架莊鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)、汶陽鎮(zhèn)。新城街道轄1個居委會、26個村委會，鄉(xiāng)村人口3.42萬人；老城鎮(zhèn)轄7個居委會、26個村委會，鄉(xiāng)村人口4.78萬人；潮泉鎮(zhèn)轄11個村委會，鄉(xiāng)村人口2.04萬人；王瓜店鎮(zhèn)轄32個村委會，鄉(xiāng)村人口5.73萬人；桃園鎮(zhèn)轄42個村委會，鄉(xiāng)村人口5.36萬人；王莊鎮(zhèn)轄53個村委會，鄉(xiāng)村人口5.38萬人；湖屯鎮(zhèn)轄4個居委會、44個村委會，鄉(xiāng)村人口4.67萬人；石橫鎮(zhèn)轄6個居委會、37個村委會，鄉(xiāng)村人口5.21萬人；安臨站鎮(zhèn)轄48個村委會，鄉(xiāng)村人口5.78萬人；孫伯鎮(zhèn)轄17個村委會，鄉(xiāng)村人口2.82萬人；安駕莊鎮(zhèn)轄71個村委會，鄉(xiāng)村人口8.10萬人；邊院鎮(zhèn)轄80個村委會，鄉(xiāng)村人口8.15萬人；汶陽鎮(zhèn)轄53個村委會，鄉(xiāng)村人口7.64萬人；儀陽鄉(xiāng)轄49個村委會，鄉(xiāng)村人口4.24萬人。（缺各鄉(xiāng)鎮(zhèn)總人口數據）

2007年底，全市總面積1277.3平方千米�？側丝�96.6萬人，其中非農業(yè)人口26.2萬人。有少數民族21個，11002人。轄1個街道、12個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：新城街道、老城鎮(zhèn)、潮泉鎮(zhèn)、王瓜店鎮(zhèn)、桃園鎮(zhèn)、王莊鎮(zhèn)、湖屯鎮(zhèn)、石橫鎮(zhèn)、安臨站鎮(zhèn)、孫伯鎮(zhèn)、安駕莊鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)、汶陽鎮(zhèn)、儀陽鄉(xiāng)，共有607個村（居）委會。

2010年7月9日，《肥城市人民政府關于調整部分鄉(xiāng)鎮(zhèn)街道行政區(qū)劃的通知》（肥政發(fā)[2010]17號）：根據《泰安市人民政府關于調整岱岳區(qū)肥城市寧陽縣東平縣部分鄉(xiāng)（鎮(zhèn)、街道）行政區(qū)劃的通知》（泰政發(fā)[2010]44號）精神，一、撤銷老城鎮(zhèn)，以其原行政區(qū)域設立老城街道辦事處，辦事處機關駐原老城鎮(zhèn)政府駐地。二、撤銷王瓜店鎮(zhèn)，以其原行政區(qū)域設立王瓜店街道辦事處，辦事處機關駐原王瓜店鎮(zhèn)政府駐地。三、撤銷儀陽鄉(xiāng)，以其原行政區(qū)域設立儀陽鎮(zhèn)，鎮(zhèn)政府駐原儀陽鄉(xiāng)政府駐地。2010年末，全市總人口97.89萬人，其中非農業(yè)人口38.07萬人。有少數民族21個，1.1萬人。全市人口密度每平方千米759人。轄3個街道、11個鎮(zhèn)：新城街道、老城街道、王瓜店街道、潮泉鎮(zhèn)、桃園鎮(zhèn)、王莊鎮(zhèn)、湖屯鎮(zhèn)、石橫鎮(zhèn)、安臨站鎮(zhèn)、孫伯鎮(zhèn)、安駕莊鎮(zhèn)、汶陽鎮(zhèn)、邊院鎮(zhèn)、儀陽鎮(zhèn)。市政府駐新城街道。