漢元鼎六年（前111）屬始安縣地，唐至德二年（757）屬臨桂縣。1913年劃入桂林縣，1940年為桂林市太沙、柘木、東附廓、西南附廓、三合、北附廓6鄉，1950年設東郊、西郊、北郊3區，1954年3區合并為近郊區，1955年更名郊區，1984年重設郊區。

1996年底行政區劃調整前，原桂林市郊區位于城區四周。面積541.8平方千米，人口約15萬人。轄2個鎮、7個鄉：柘木鎮、雁山鎮、大河鄉、朝陽鄉、穿山鄉、甲山鄉、二塘鄉、大埠鄉、草坪回族鄉。區政府駐市區依仁路。

1996年12月2日，國務院批準：將桂林市郊區更名為雁山區，并對桂林市市轄區的行政區劃作相應調整。將原郊區大河鄉、穿山鄉的清風村劃歸疊彩區管轄。將原郊區甲山鄉劃歸秀峰區管轄。將原郊區的二塘鄉、柘木鎮的同心、平山兩個村和穿山鄉的安新村劃歸象山區管轄。將原郊區的穿山鄉（不含清風、安新兩個村）、朝陽鄉劃歸七星區管轄。雁山區轄原郊區的雁山鎮、柘木鎮（不含同心、平山兩個村）、大埠鄉、草坪回族鄉。區人民政府駐雁山鎮。

2000年第五次人口普查，雁山區總人口67833人，其中：雁山鎮23811人，柘木鎮26601人，大埠鄉12704人，草坪回族鄉4717人。

2003年雁山區行政區劃（根據當年廣西行政區劃代碼整理）
　　001　雁山街道　轄雁山街社區居委會。
　　100　雁山鎮　轄東立、楓林、周家、文家、三合、果園、羅安、良豐、興隆、竹園、莫家、云塘、五塘、茶江、三立15個村委會。
　　101　柘木鎮　轄柘木街社區居委會；蘇家、衛家渡、窯頭、柘木、龍門、祿坊、李家、何家8個村委會。
　　200　大埠鄉　轄汕坪、塘頭、付上、草底、黃宿、八愷、黎家、大埠、付中、陶家、臘山11個村委會。
　　201　草坪回族鄉　轄草坪街社區居委會；草坪、潛經、田村3個村委會。

2007年11月9日，雁山區政府遷至雁山鎮雁山街389號。2011年3月30日，雁山街道辦事處正式掛牌成立，轄雁山區城區部分（面積13.5平方千米），雁山鎮轄原雁山鎮農村部分。