春秋時為蕭國地。秦置蕭縣，以古蕭國為名，治今龍城鎮(zhèn)西北5千米三仙臺附近，屬泗水郡。隋開皇六年（586）改為龍城縣，十八年（598）改為臨沛縣，隋大業(yè)初復(fù)名蕭縣，屬徐州。金元光二年（1223）析置永堌縣，治今永堌鎮(zhèn)。元至元二年（1265）并蕭縣、永堌縣入徐州。明萬歷五年（1577）因大水遷治于今址。清屬徐州府。1949年4月屬宿縣專區(qū)，1952年屬江蘇省，1955年屬宿縣專區(qū)，1956年屬蚌埠專區(qū)，1961年屬宿縣專區(qū)。

　　1997年，蕭縣面積1885平方千米，人口120萬，轄18鎮(zhèn)4鄉(xiāng)：龍城鎮(zhèn)、黃口鎮(zhèn)、楊樓鎮(zhèn)、閻集鎮(zhèn)、新莊鎮(zhèn)、劉套鎮(zhèn)、馬井鎮(zhèn)、大屯鎮(zhèn)、趙莊鎮(zhèn)、杜樓鎮(zhèn)、丁里鎮(zhèn)、王寨鎮(zhèn)、祖樓鎮(zhèn)、永堌鎮(zhèn)、白土鎮(zhèn)、官橋鎮(zhèn)、青龍集鎮(zhèn)、張莊寨鎮(zhèn)、圣泉鄉(xiāng)、酒店鄉(xiāng)、莊里鄉(xiāng)、孫圩子鄉(xiāng)。縣政府駐龍城鎮(zhèn)。
　　2000年第五次人口普查，全縣總?cè)丝?196377人，其中（18個鎮(zhèn)、5個鄉(xiāng)）：龍城鎮(zhèn)115565人，黃口鎮(zhèn)80011人，楊樓鎮(zhèn)69473人，閏集鎮(zhèn)44509人，新莊鎮(zhèn)66690人，劉套鎮(zhèn)42491人，馬井鎮(zhèn)68720人，大屯鎮(zhèn)59539人，趙莊鎮(zhèn)60943人，杜樓鎮(zhèn)62143人，丁里鎮(zhèn)38630人，王寨鎮(zhèn)66941人，祖樓鎮(zhèn)39568人，青龍鎮(zhèn)25003人，張莊寨鎮(zhèn)68560人，永堌鎮(zhèn)29564人，白土鎮(zhèn)33237人，官橋鎮(zhèn)19507人，圣泉鄉(xiāng)64791人，酒店鄉(xiāng)52025人，孫圩孜鄉(xiāng)42132人，莊里鄉(xiāng)25087人，石林鄉(xiāng)21247人。
　　2004年底，蕭縣轄18個鎮(zhèn)、5個鄉(xiāng)：龍城鎮(zhèn)、黃口鎮(zhèn)、楊樓鎮(zhèn)、閏集鎮(zhèn)、新莊鎮(zhèn)、劉套鎮(zhèn)、馬井鎮(zhèn)、大屯鎮(zhèn)、趙莊鎮(zhèn)、杜樓鎮(zhèn)、丁里鎮(zhèn)、王寨鎮(zhèn)、祖樓鎮(zhèn)、青龍鎮(zhèn)、張莊寨鎮(zhèn)、永堌鎮(zhèn)、白土鎮(zhèn)、官橋鎮(zhèn)、圣泉鄉(xiāng)、酒店鄉(xiāng)、孫圩孜鄉(xiāng)、莊里鄉(xiāng)、石林鄉(xiāng)。