2015年4月28日，國(guó)務(wù)院（國(guó)函[2015]74號(hào)）批復(fù)同意撤銷潼南縣，設(shè)立重慶市潼南區(qū)，以原潼南縣的行政區(qū)域?yàn)殇蠀^(qū)的行政區(qū)域，潼南區(qū)人民政府駐桂林街道興潼大道108號(hào)。
古為梁州蜀郡梓州路（今三臺(tái)縣，清為潼川府）遂寧、蓬溪兩縣屬地。1912年由蓬溪、遂寧二縣析置東安縣，設(shè)縣治于舊梓潼鎮(zhèn)，屬潼川府。1914年更名潼南縣，因地處潼川府之南而得名（民國(guó)三年內(nèi)務(wù)部來(lái)文，因東安縣與直隸、湖南、廣東等省重復(fù)，自應(yīng)酌改，查該縣設(shè)置于梓潼鎮(zhèn)，歸潼川府轄地，居府南，遂定名為潼南縣）。同年裁府設(shè)道，隸屬川北道。民國(guó)二十四年（1935年）廢道，隸屬四川省第十二行政督察區(qū)。
1949年潼南解放后，屬川北行政公署遂寧專區(qū)。1953年合省后，屬四川省遂寧專區(qū)。1958年遂寧、綿陽(yáng)專區(qū)合并，隸屬綿陽(yáng)專區(qū)。1976年調(diào)整行政區(qū)域，隸屬江津地區(qū)。1981年江津地區(qū)改為永川地區(qū)。1983年撤銷永川地區(qū)，隸屬重慶市。
1953年，將合川縣別口鄉(xiāng)、萬(wàn)壽區(qū)甑子場(chǎng)、安岳縣白水鄉(xiāng)第八村曾家小灣及龍橋溝等處劃歸潼南縣。
1994年1月撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)后，潼南縣轄梓潼、雙江、塘壩、柏梓、光輝、小渡、臥佛、太安、上和、古溪、桂林、寶龍、龍形、新勝、玉溪、花巖、飛躍、米心、群力、五桂、新華、永勝22個(gè)鎮(zhèn)；田家、永安、文明、安興、龍項(xiàng)、檬子、別口、紅花、壽橋9個(gè)鄉(xiāng)。
1999年7月9日，重慶市政府（渝府[1999]123號(hào)）批復(fù)同意潼南縣縣委、人大、政府、政協(xié)機(jī)關(guān)駐地由梓潼鎮(zhèn)正興街27號(hào)、23號(hào)、34號(hào)、59號(hào)遷至梓潼鎮(zhèn)蓮花村擬新建的行政中心內(nèi)。2000年7月光輝鎮(zhèn)更名為崇龕鎮(zhèn)。
2000年第五次人口普查，潼南縣常住總?cè)丝?60016人，其中：梓潼鎮(zhèn)118646人、上和鎮(zhèn)30323人、龍形鎮(zhèn)24883人、古溪鎮(zhèn)35298人、寶龍鎮(zhèn)27341人、飛躍鎮(zhèn)15999人、新華鎮(zhèn)12947人、玉溪鎮(zhèn)23928人、米心鎮(zhèn)15849人、群力鎮(zhèn)20781人、雙江鎮(zhèn)47814人、桂林鎮(zhèn)31149人、花巖鎮(zhèn)12782人、柏梓鎮(zhèn)46867人、崇龕鎮(zhèn)43348人、塘壩鎮(zhèn)62765人、新勝鎮(zhèn)27034人、太安鎮(zhèn)35755人、永勝鎮(zhèn)8086人、小渡鎮(zhèn)47035人、臥佛鎮(zhèn)39944人、五桂鎮(zhèn)13688人、田家鄉(xiāng)14323人、龍項(xiàng)鄉(xiāng)11576人、檬子鄉(xiāng)13071人、別口鄉(xiāng)11959人、紅花鄉(xiāng)15707人、安興鄉(xiāng)11313人、文明鄉(xiāng)13623人、永安鄉(xiāng)15137人、壽橋鄉(xiāng)11045人。
2002年末，潼南縣轄22個(gè)鎮(zhèn)、9個(gè)鄉(xiāng)，21個(gè)居委會(huì)、283個(gè)行政村，戶籍總?cè)丝?0.43萬(wàn)人，其中非農(nóng)業(yè)人口9.46萬(wàn)人。
2006年6月16日，重慶市政府（渝府[2006]126號(hào)）批復(fù)同意潼南縣將31個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)調(diào)整為22個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)和街道。其中，撤銷5個(gè)鎮(zhèn)、6個(gè)鄉(xiāng)，設(shè)立2個(gè)街道，調(diào)整6個(gè)鎮(zhèn)、2個(gè)鄉(xiāng)行政區(qū)域范圍，保留11個(gè)鎮(zhèn)、1個(gè)鄉(xiāng)行政區(qū)域政府和駐地不變。具體為：撤銷梓潼鎮(zhèn)、桂林鎮(zhèn)，設(shè)立梓潼街道、桂林街道；撤銷新華鎮(zhèn)，并入米心鎮(zhèn)；撤銷飛躍鎮(zhèn)、紅花鄉(xiāng)，并入古溪鎮(zhèn)；撤銷永勝鎮(zhèn)，并入田家鄉(xiāng)；撤銷文明鄉(xiāng)、永安鄉(xiāng)，并入柏梓鎮(zhèn)；撤銷龍項(xiàng)鄉(xiāng)，并入田家鄉(xiāng)、別口鄉(xiāng)；撤銷檬子鄉(xiāng)，并入龍形鎮(zhèn)；撤銷安興鄉(xiāng)，并入雙江鎮(zhèn)、玉溪鎮(zhèn)。
2010年第六次人口普查，潼南縣常住總?cè)丝?39985人，其中：桂林街道60294人，梓潼街道152525人，上和鎮(zhèn)20654人，龍形鎮(zhèn)24526人，古溪鎮(zhèn)34633人，寶龍鎮(zhèn)14600人，玉溪鎮(zhèn)16463人，米心鎮(zhèn)13854人，群力鎮(zhèn)10951人，雙江鎮(zhèn)33771人，花巖鎮(zhèn)6050人，柏梓鎮(zhèn)47879人，崇龕鎮(zhèn)27745人，塘壩鎮(zhèn)45385人，新勝鎮(zhèn)15743人，太安鎮(zhèn)24258人，小渡鎮(zhèn)27469人，臥佛鎮(zhèn)24209人，五桂鎮(zhèn)8341人，田家鄉(xiāng)16368人，別口鄉(xiāng)7879人，壽橋鄉(xiāng)6388人。
2011年4月29日，重慶市政府（渝府[2011]37號(hào)）批復(fù)同意撤銷田家鄉(xiāng)、別口鄉(xiāng)、壽橋鄉(xiāng)，設(shè)立田家鎮(zhèn)、別口鎮(zhèn)、壽橋鎮(zhèn)。調(diào)整后，全縣轄2個(gè)街道、20個(gè)鎮(zhèn)：梓潼街道、桂林街道、上和鎮(zhèn)、龍形鎮(zhèn)、古溪鎮(zhèn)、寶龍鎮(zhèn)、玉溪鎮(zhèn)、米心鎮(zhèn)、群力鎮(zhèn)、雙江鎮(zhèn)、花巖鎮(zhèn)、柏梓鎮(zhèn)、崇龕鎮(zhèn)、塘壩鎮(zhèn)、新勝鎮(zhèn)、太安鎮(zhèn)、小渡鎮(zhèn)、臥佛鎮(zhèn)、五桂鎮(zhèn)、田家鎮(zhèn)、別口鎮(zhèn)、壽橋鎮(zhèn)。