秦始皇二十六年（公元前221）置商縣。隋開皇四年（584）更名商洛縣。金貞元二年（1154）縣廢。1915年設商縣分縣，1931年廢。1947年分商縣、洛南、山陽三縣地于龍駒寨設立龍駒設治局。

1949年改設為丹鳳縣。因縣城南臨丹江、北依鳳冠山而得名。1950年屬商洛專區。1958年撤銷縣制，轄地分別劃入商縣、商南縣、山陽縣。1961年改丹鳳縣。1969年屬商洛地區。2001年屬商洛市。

1996年，丹鳳縣面積2438平方千米，人口29萬人。轄7個區公所，3鎮40鄉：龍駒寨鎮、鐵峪鋪鎮、商鎮鎮、茶房鄉、棣花鄉、大峪鄉、留仙坪鄉、庵底鄉、寺坪鄉、牌樓河鄉、毛里崗鄉、花園鄉、竹林關鄉、張家塬鄉、東嶺鄉、西嶺鄉、古路河鄉、土門鄉、石槽溝鄉、龍王廟河鄉、桃花鋪鄉、蘇溝鄉、花瓶子鄉、白陽關鄉、東毛坪鄉、武關鄉、梨園岔鄉、北趙川鄉、爐道鄉、蔡川鄉、南石門鄉、庾家河鄉、巒莊鄉、馬家坪鄉、黃柏岔鄉、桃坪鄉、峽河鄉、西河鄉、河南鄉、月日鄉、資峪鄉、雙槽鄉、涌峪鄉。縣政府駐龍駒寨鎮。

1997年，撤銷商鎮、寺坪、竹林關、鐵峪鋪、巒莊、庾嶺、鳳冠等7個區公所建制，撤銷西河鄉、河南鄉并入龍駒寨鎮，撤銷桃花鋪鄉并入鐵峪鋪鎮，撤銷茶坊鄉、棣花鄉合并設立棣花鎮，撤銷東毛坪鄉、武關鄉合并設立武關鎮，撤銷黃柏岔鄉、巒莊鄉合并設立巒莊鎮，撤銷爐道鄉、庾家河鄉合并設立庾嶺鎮，撤銷庵底鄉、蔡川鄉合并設立蔡川鎮，撤銷牌樓河鄉、寺坪鄉合并設立寺坪鎮，撤銷龍王廟鄉、土門鄉、古路河鄉合并設立土門鎮，撤銷張塬鄉、竹林關鄉、西嶺鄉合并設立竹林關鎮，撤銷蘇溝鄉并入花瓶子鄉，撤銷梨園鄉并入北趙川鄉，撤銷南石門鄉并入馬家坪鄉（此處待考證；原南石門鄉轄區現在屬庾嶺鎮）；撤銷峽河鄉，將其轄區的金灣、銀坪、雙峰3個村委會劃歸桃坪鄉管轄。調整后，丹鳳縣轄11個鎮、15個鄉：龍駒寨鎮、鐵峪鋪鎮、商鎮、棣花鎮、大峪鄉、留仙坪鄉、寺坪鎮、毛里崗鄉、花園鄉、竹林關鎮、東嶺鄉、土門鎮、石槽溝鄉、花瓶子鄉、白陽關鄉、武關鎮、北趙川鄉、蔡川鎮、庾嶺鎮、巒莊鎮、馬家坪鄉、桃坪鄉、月日鄉、資峪鄉、雙槽鄉、涌峪鄉。

2000年第五次人口普查，全縣常住總人口295833人，其中：龍駒寨鎮51413人，竹林關鎮16755人，土門鎮13410人，寺坪鎮9131人，棣花鎮21228人，商鎮鎮18605人，鐵峪鋪鎮17390人，武關鎮10505人，巒莊鎮10893人，庾嶺鎮12223人，蔡川鎮9237人，東嶺鄉4415人，石槽溝鄉4548人，毛里崗鄉4395人，花園鄉5134人，大峪鄉9027人，留仙坪鄉6448人，月日鄉8582人，涌峪鄉6535人，雙槽鄉7923人，資峪鄉9748人，花瓶子鄉10311人，白陽關鄉4179人，北趙川鄉7692人，桃坪鄉7028人，馬家坪鄉9078人。

2001年，撤銷涌峪鄉并入龍駒寨鎮，撤銷馬家坪鄉并入巒莊鎮，撤銷白陽關鄉并入武關鎮，撤銷石槽溝鄉并入竹林關鎮，撤銷大峪鄉并入商鎮鎮。調整后，丹鳳縣轄11個鎮、10個鄉：龍駒寨鎮、庾嶺鎮、蔡川鎮、巒莊鎮、鐵峪鋪鎮、武關鎮、竹林關鎮、土門鎮、寺坪鎮、商鎮鎮、棣花鎮、月日鄉、雙槽鄉、資峪鄉、桃坪鄉、花瓶子鄉、北趙川鄉、東嶺鄉、毛里崗鄉、花園鄉、留仙坪鄉。

2009年？，全縣轄21個鄉鎮，208個村，1823個村民小組，75653戶，301582人，農業人口276518人，縣城龍駒寨人口約5萬人。

2010年第六次人口普查，丹鳳縣常住總人口295349人，其中：龍駒寨鎮65934人，庾嶺鎮15797人，蔡川鎮8789人，巒莊鎮14664人，鐵峪鋪鎮16116人，武關鎮13489人，竹林關鎮22202人，土門鎮13293人，寺坪鎮8652人，商鎮28728人，棣花鎮20521人，月日鄉8595人，雙槽鄉7509人，資峪鄉9287人，桃坪鄉6380人，花瓶子鄉8879人，北趙川鄉7453人，東嶺鄉4367人，毛里崗鄉3910人，花園鄉5031人，留仙坪鄉5753人。

2011年，撤銷雙槽鄉、資峪鄉合并設立資峪鎮，撤銷留仙坪鄉并入商鎮鎮，撤銷東嶺鄉并入竹林關鎮，撤銷花園鄉、毛里崗鄉并入寺坪鎮；撤銷北趙川鄉、桃坪鄉、月日鄉、花瓶子鄉鄉的建制，相應設立鎮的建制。調整后，丹鳳縣轄16個鎮：龍駒寨鎮、庾嶺鎮、蔡川鎮、巒莊鎮、鐵峪鋪鎮、武關鎮、竹林關鎮、土門鎮、寺坪鎮、商鎮鎮、棣花鎮、月日鎮、資峪鎮、桃坪鎮、花瓶子鎮、北趙川鎮。共有208個行政村（社區），1823個村（居）民小組。全縣總人口30.2萬人，其中農業人口27.71萬人。

2012年末，丹鳳縣面積2407.4平方千米，戶籍人口309187人，常住人口29.53萬人。2013年末，丹鳳縣轄16個鎮，共有12個社區、196個行政村，縣政府駐龍駒寨鎮。

根據陜民發[2014]57號、陜民發[2015]9號、商政民發[2015]15號文件，撤銷資峪鎮、月日鎮、龍駒寨鎮，設立龍駒寨街道，街道辦事處駐鳳麓社區；撤銷北趙川鎮，并入武關鎮，鎮政府駐武關村；撤銷桃坪鎮，并入巒莊鎮，鎮政府駐街坊社區；將商鎮留仙坪村、油房街村、頁山村并入蔡川鎮；將花瓶子鎮雙河村并入鐵峪鋪鎮李山村，將土門鎮東樓村、八龍廟村并入竹林關鎮；竹林關鎮政府駐地由竹林關村遷至丹水社區；在原月日鎮、桃坪鎮、北趙川鎮政府所在地分別設立便民服務中心；全縣撤并51個村、4個居委會，保留132個村、23個社區。調整后，丹鳳縣轄龍駒寨1個街道和商鎮、棣花、鐵峪鋪、武關、竹林關、土門、蔡川、庾嶺、巒莊、寺坪、花瓶子11個鎮，共有132個行政村、23個社區。