秦始皇二十六年（公元前221年）置新淦縣。因當(dāng)時縣治臨近紫淦山及淦水，因而得名。1957年，因字生僻，改新淦縣為新干縣。

　　1984年，恢復(fù)金川鎮(zhèn)，管轄原金川公社范圍（贛府廳字[1984]198號）。1985年6月19日，三湖鄉(xiāng)改設(shè)鎮(zhèn)建制（贛府廳字[1985]340號）。1993年，撤銷大洋洲鄉(xiāng)、七琴鄉(xiāng)，設(shè)立大洋洲鎮(zhèn)、七琴鎮(zhèn)（贛民字[1993]53號批復(fù)）。
　　1997年11月25日，撤銷麥斜鄉(xiāng)，設(shè)立麥斜鎮(zhèn)（贛民字[1997]230號批復(fù)）。全縣轄5鎮(zhèn)9鄉(xiāng)，面積1248.3平方千米，人口29.4萬。
　　1998年5月31日，撤銷塘頭鄉(xiāng)，設(shè)立塘頭鎮(zhèn)（贛民字[1998]222號批復(fù)），至此全縣轄6個鎮(zhèn)、8個鄉(xiāng)。
　　2000年根據(jù)第五次人口普查數(shù)據(jù)，全縣總?cè)丝?86348人；其中：金川鎮(zhèn)38162人、塘頭鎮(zhèn)23925人、三湖鎮(zhèn)35563人、大洋洲鎮(zhèn)22919人、七琴鎮(zhèn)28159人、麥斜鎮(zhèn)19156人、溧江鄉(xiāng)17228人、桃溪鄉(xiāng)12709人、城上鄉(xiāng)12469人、潭丘鄉(xiāng)17399人、神政橋鄉(xiāng)9458人、沂江鄉(xiāng)11004人、界埠鄉(xiāng)21511人、荷浦鄉(xiāng)16686人。
　　2001年12月3日，撤銷塘頭鎮(zhèn)，劃歸金川鎮(zhèn)，金川鎮(zhèn)政府駐地遷至塘頭（贛民字[2001]569號批復(fù)）。2002年底，新干縣轄5個鎮(zhèn)、8個鄉(xiāng)，9個居委會、169個行政村。
　　2003年底，全縣總?cè)丝?0.2萬人。2005年末全縣總?cè)丝跒?05844人，其中非農(nóng)業(yè)人口68927人，農(nóng)業(yè)人口236917人。2006年末全縣總?cè)丝跒?08198人，其中非農(nóng)業(yè)人口68024人。
　　2010年12月28日，《江西省民政廳關(guān)于同意新干縣界埠鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)的批復(fù)》（贛民字[2010]172號）：經(jīng)省人民政府批準(zhǔn)，同意撤銷新干縣界埠鄉(xiāng)，設(shè)立界埠鎮(zhèn)。新設(shè)立的界埠鎮(zhèn)行政區(qū)域范圍保持原界埠鄉(xiāng)的行政區(qū)域范圍不變，鎮(zhèn)政府仍駐界埠。
　　2012年9月7日，《江西省民政廳關(guān)于同意新干縣溧江鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)的批復(fù)》（贛民字[2012]120號）：經(jīng)省人民政府批準(zhǔn)，同意撤銷新干縣溧江鄉(xiāng)，設(shè)立溧江鎮(zhèn)。新設(shè)立的溧江鎮(zhèn)行政區(qū)域范圍保持原溧江鄉(xiāng)的行政區(qū)域范圍不變，鎮(zhèn)政府駐原鄉(xiāng)政府駐地。