寶清縣，以境內東部寶清河得名。寶清河，一說系滿語“寶其赫”的轉音，原意為“丑”；一說滿語“猴子”的意思。清初屬寧古塔副都統管轄，1732年（清雍正十年）劃歸三姓副都統管轄。清末，1906年（清光緒三十二年），劃歸臨江州（后改臨江府）管轄。1909年6月2日（清宣統元年四月十五日），吉林巡撫奏準，于寶清河西設置寶清州（擬從緩設置）。中華民國成立后，1912年臨江府于寶清設置分防經歷，1914年改為分治員。

1916年4月15日，奉令將寶清分治地方“改設縣治”，名為寶清縣，隸屬依蘭道。縣境東西寬120千米，南北長100千米。1929年2月，撤銷道制，改由吉林省直轄。東北淪陷后，初隸吉林省，1934年12月劃歸三江省管轄。1938年將饒河縣七里沁河以西地區劃歸寶清縣管轄。1939年6月，劃歸新設之東安省管轄。1943年后，先后隸屬東滿總省和東滿省管轄。1945年“九三”抗日戰爭勝利后，劃歸合江省管轄。

（1946年7月2日建立寶清縣民主政府）1947年8月，劃歸牡丹江省管轄。1948年7月，撤銷牡丹江省，復歸合江省管轄。1949年5月，撤銷合江省，劃歸松江省管轄。1954年8月，松、黑兩省合并后，劃歸黑龍江省合江專區管轄。1983年10月，將西南部的宏偉、嵐峰兩個公社劃歸七臺河市管轄。1985年1月1日，正式撤銷合江地區，劃歸佳木斯市領導。1991年4月1日，由佳木斯市劃歸雙鴨山市領導（2月2日國務院國函[1991]4號批準）。

1992年末，寶清縣位于黑龍江省東部，完達山北麓。東、南以七里沁河、完達山脊與饒河縣、虎林縣、密山市和七臺河市分界，西與勃利縣、樺南縣和雙鴨山市接壤，北以七星河與友誼縣、富錦市毗鄰。全縣總面積10001.2平方千米。總人口40.6萬人，其中非農業人口13.3萬人，占32.76%；滿、朝鮮、蒙古、回等少數民族人口2.7萬人，占6.7%。轄17個鄉鎮。縣政府駐地寶清鎮。（以上摘自《黑龍江省志·地名錄》，有改動）

1996年，寶清縣面積1.1萬平方千米，人口40.5萬人。轄3個鎮、14個鄉：寶清鎮、七星泡鎮、青原鎮、夾信子鄉、十八里鄉、涼水鄉、建平鄉、萬金山鄉、尖山子鄉、寶山鄉、朝陽鄉、七星河鄉、東升鄉、富山鄉、小城子鄉、龍頭鄉、東興鄉。縣政府駐寶清鎮。

2000年第五次人口普查，寶清縣（轄4個鎮、13個鄉）總人口399083人，其中：寶清鎮76852人，七星泡鎮39011人，青原鎮23918人，夾信子鎮21065人，萬金山鄉17798人，尖山子鄉10162人，朝陽鄉11635人，龍頭鄉11831人，小城子鄉11670人，十八里鄉12869人，涼水鄉14069人，七星河鄉8444人，富山鄉4744人，東興鄉4641人，東升鄉5171人，建平鄉3370人，寶山鄉4469人，五九七農場28959人，八五二農場49868人，八五三農場38537人。

全縣現轄6個鎮、4個鄉：寶清鎮、七星泡鎮、青原鎮、夾信子鎮、龍頭鎮、小城子鎮、朝陽鄉、萬金山鄉、尖山子鄉、七星河鄉。