武清，古為泉州（是指漢朝以前近海邊疆的羈糜州），昔號雍陽。漢泉州（西漢元封五年立縣）、雍奴二縣之地。泉州和雍奴二縣均因水得名。武清縣內古有“泉州渠”，故稱泉州�！端涀ⅰ吩疲骸坝号�，藪澤之名。四面有水曰雍，澄而不流曰奴。雍奴藪甚大，東極于海�！比菘h城在今黃莊街道城上村北。雍奴縣城在三角淀（今王慶坨鎮東9千米處）。
北魏太平真君七年（448年）省泉州縣入雍奴縣。雍奴縣治后來遷至今泗村店鎮舊縣村。唐天寶元年（742年）更名武清縣。明洪武初遷治于元衛帥府鎮撫衙（今城關鎮）。1949年后武清縣曾屬河北省天津地區。1950午10月遷治于楊村鎮。1973年劃歸天津市。2000年6月13日，國務院（國函[2000]67號）批復同意撤銷武清縣，設立武清區，區政府駐楊村鎮。
1988年，城關、崔黃口、河西務、王慶坨等鄉撤鄉設鎮。1990年大良鄉撤鄉設鎮。1991年梅廠鄉撤鄉設鎮。1995年，南蔡村、泗村店、東馬圈、石各莊等鄉撤鄉設鎮。1996年大孟莊鄉撤鄉設鎮。
1996年，武清縣面積1574平方千米，人口約79萬人。轄12個鎮、22個鄉：楊村鎮、崔黃口鎮、梅廠鎮、大良鎮、泗村店鎮、大孟莊鎮、河西務鎮、東馬圈鎮、石各莊鎮、王慶坨鎮、城關鎮、南蔡村鎮、徐官屯鄉、大堿廠鄉、后巷鄉、河北屯鄉、大黃堡鄉、黃莊鄉、上馬臺鄉、曹子里鄉、北蔡村鄉、陳咀鄉、雙樹鄉、豆張莊鄉、東蒲洼鄉、高村鄉、大沙河鄉、聶莊子鄉、白古屯鄉、 下朱莊鄉、大王古莊鄉、黃花店鄉、下伍旗鄉、汊沽港鄉�？h政府駐楊村鎮。
2000年，武清區轄17個鎮、17個鄉：楊村鎮、崔黃口鎮、河西務鎮、王慶坨鎮、城關鎮、梅廠鎮、大良鎮、下伍旗鎮、南蔡村鎮、大孟莊鎮、泗村店鎮、東馬圈鎮、石各莊鎮、汊沽港鎮、大堿廠鎮、黃花店鎮、河北屯鎮、徐官屯鄉、東蒲洼鄉、黃莊鄉、豆張莊鄉、聶莊子鄉、上馬臺鎮、曹子里鄉、大黃堡鄉、后巷鄉、雙樹鄉、北蔡村鄉、大沙河鄉、高村鄉、白古屯鄉、下朱莊鄉、陳嘴鎮、大王古莊鄉。
2000年第五次人口普查，武清區總人口814752人，其中：楊村鎮92871人、梅廠鎮18204人、大堿廠鎮20108人、崔黃口鎮34658人、大良鎮26069人、下伍旗鎮25095人、南蔡村鎮24473人、大孟莊鎮22911人、泗村店鎮16728人、河西務鎮24982人、城關鎮26337人、東馬圈鎮15074人、黃花店鎮23659人、石各莊鎮21410人、王慶坨鎮36270人、漢沽港鎮33913人、徐官屯鄉13415人、東蒲洼鄉24403人、黃莊鄉20839人、豆張莊鄉21644人、聶莊子鄉12968人、上馬臺鄉16381人、曹子里鄉22085人、大黃堡鄉17290人、后巷鄉19911人、河北屯鄉31388人、雙樹鄉15372人、北蔡村鄉17422人、大沙河鄉15701人、高村鄉17756人、自古屯鄉21304人、大王古莊鄉20899人、陳咀鄉29329人、下朱莊鄉11851人、武清農場2032人。
2001年，撤銷聶莊子鄉，并入梅廠鎮；撤銷后巷鄉，并入崔黃口鎮；撤銷雙樹鄉，并入大良鎮；撤銷北蔡村鄉，并入南蔡村鎮；撤銷大沙河鄉，并入河西務鎮；河北屯、大王古莊、陳咀等鄉撤鄉設鎮。鄉鎮區劃調整后，武清區轄6個街道（其中有農業街道6個）、19個鎮、5個鄉：運河東街道、運河西街道、南湖街道、北嵐街道、鳳河街道、泉州街道，大良鎮、崔黃口鎮、梅廠鎮、南蔡村鎮、河西務鎮、河北屯鎮、大減廠鎮、下武旗鎮、城關鎮、黃花店鎮、石各莊鎮、王慶坨鎮、汊沽港鎮、東馬圈鎮、泗村店鎮、大孟莊鎮、上馬臺鎮、大王古莊鎮、陳嘴鎮，白古屯鄉、高村鄉、豆張莊鄉、曹子里鄉、大黃堡鄉。
2004年初，武清區轄6個街道、19個鎮、5個鄉：楊村街道、運河西街道、徐官屯街道、下朱莊街道、黃莊街道、東蒲洼街道，東馬圈鎮、黃花店鎮、石各莊鎮、王慶坨鎮、汊沽港鎮、陳嘴鎮、梅廠鎮、上馬臺鎮、崔黃口鎮、河北屯鎮、下伍旗鎮、大良鎮、大堿廠鎮、南蔡村鎮、大孟莊鎮、泗村店鎮、河西務鎮、城關鎮、大王古莊鎮，豆張莊鄉、大黃堡鄉、曹子里鄉、高村鄉、白古屯鄉。
2013年，撤銷豆張莊鄉、曹子里鄉、大黃堡鄉、高村鄉、白古屯鄉，設立豆張莊鎮、曹子里鎮、大黃堡鎮、高村鎮、白古屯鎮（津民復[2013]6號）。調整后，全區轄6個街道、24個鎮：楊村街道、下朱莊街道、東蒲洼街道、黃莊街道、徐官屯街道、運河西街道、梅廠鎮、大堿廠鎮、崔黃口鎮、大良鎮、下伍旗鎮、南蔡村鎮、大孟莊鎮、泗村店鎮、河西務鎮、城關鎮、東馬圈鎮、黃花店鎮、石各莊鎮、王慶坨鎮、汊沽港鎮、河北屯鎮、上馬臺鎮、大王古莊鎮、陳咀鎮、豆張莊鎮、曹子里鎮、大黃堡鎮、高村鎮、白古屯鎮。區政府駐運河西街道雍陽西道118號。