1991年11月，以原汕頭經濟特區龍湖片區為主體，劃入原郊區下蓬鎮，始設龍湖區。1996年，面積46.3平方千米，常住人口20多萬人。轄4個街道、1個鎮：新津街道、珠池街道、龍湖街道、金霞街道、下蓬鎮。2000年，龍湖區轄8個街道。

2000年第五次人口普查，龍湖區常住總人口255888人，其中：金霞街道29233人，龍湖街道26909人，珠池街道56965人，新滓街道64109人，鷗汀街道29934人，龍津街道20212人，漁洲街道14749人，龍祥街道13777人。2002年，龍湖區轄珠泡、龍湖、金霞、新津、龍津、移洲、龍祥、歐汀8個街道，共有5個村委會、64個居委會。

2003年1月29日，國務院批準（國函[2003]11號）：將原澄海市的外砂、新溪2個鎮、原金園區高新技術開發區東片區域（即東起天山北路，西至華山北路，南起汕頭經濟特區北界線，北至科技北三街向南轉向科技西路再轉向科技北二街）劃歸龍湖區管轄。4月1日，完成了原澄海市外砂鎮、新溪鎮行政管轄權的移交工作。

2003年，龍湖區轄珠池、金霞、新津、龍祥、鷗汀5個街道和新溪、外砂2個鎮，共有75個居委會、32個村委會。全區總人口90961戶337406人，金霞街道11044戶40841人；珠池街道15210戶50579人；新津街道12794戶39762人；鷗汀街道13230戶41849人；龍祥街道7275戶23986人；外砂鎮18140戶79467人；新溪鎮13268戶60922人。

2008年末，全區面積100.7平方千米，戶籍總人口379990人。2009年末，龍湖區轄5個街道、2個鎮，78個居委會、32個行政村。區政府駐大北山路1號。

2010年第六次人口普查，龍湖區常住總人口536356人，其中：金霞街道69826人，珠池街道136289人，新津街道90471人，鷗汀街道45884人，龍祥街道41795人，外砂鎮86659人，新溪鎮65432人。2012年末，全區面積103.13平方千米，戶籍人口40.99萬人，常住人口54萬人。